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智门禅寺始建于后周四年（957），原名保安院。治平二年（1065），林旦任象山县令，智门禅寺与等慈禅寺、延寿禅寺、常乐禅寺、宝梵讲寺、普明律寺以及栖霞观（原名蓬莱观），一起悉被改赐新额。一县之中，六寺一观同时换上新额，各有一番热闹，洵为合邑盛事；与县令林旦之重视县内文化建设也不无关系。
以“智门”为寺名，与旧称“保安”相较，确有新的含蕴。“智”为儒家常用语，即梵语“般若”意译，“智门”意为智慧之门。可见当年主寺者兼通儒释，颇有修养，与当时兼通儒、释、道的文人学士，自能同气相求。智门寺自此“缁徒相授，梵宇漫广”，同时在经济上具有雄厚实力，据《宝庆四明志》载，有“常住田674亩，山2244亩”。寺院之盛，可以想见。
后来，智门寺竟有了一块《赤壁赋》碑。据于弈正《天下金石记》载：“智门寺《赤壁赋》，黄庭坚书。按：山谷（黄庭坚）所书，即苏文忠（苏东坡）《前后赤壁赋》，此正象山一宋碑也。象山旧志失之。”
